Budapesti Műszaki és Gazdaságtudományi Egyetem - BME -- Távközlési és Médiainformatikai Tanszék - TMIT BME - Távközlési és Mesterséges Intelligencia Tanszék - TMIT
 
 
| Témakiírások | | | | | IW  
 
 
Önálló labor
Kiírt témák

Ez egy előző félévben kiírt, archivált téma.

Idegsejtek és hálózati aktivitás analízise deep learning segítségével (Analysing biological neurons with deep learning)

Ipari partner: APPERCELL Biotech Kft.

Az idegsejtek (neuronok) közötti információáramlásban kulcs fontosságú az akciós potenciálok generálása, küldése és fogadása. A neuronok és a belőlük formálódó hálózatok az akciós potenciálokkal vagy más néven spikeok-al kommunikálnak egymással. Ebben az esetben a biológiai neuronokat és a belőlük formálódó hálózatokat speciális tálcán tenyésztik ki, amelyen sok mérőluk (12, 48, 96 ) helyezkedik el. A mérőlukak alján kis méretű (50um) elektródok vannak nagy számban elhelyezve, amelyek segítségével a sejtek, illetve a hálózatban létrejövő és terjedő neurális spikeok rögzíthetők. A mérőrendszer segítségével 768 elektródról (csatornák) tudunk párhuzamosan jelet elvezetni 20-30kHz-es mintavételezési frekvenciával. Mivel egy elektród közelében több neuron is elhelyezkedhet és spikeolhat (tüzelhet) előfordul, hogy egy csatornás adatfolyamban több neuron tüzelését is rögzítjük. A hallgató előzetesen rögzített adasorokon dolgozna, de lehetőség van új adatok rögzítésére is. A feladat a mostaniakon túlmutató algoritmus fejlesztése, amely a nyers jelfolyamból a spikeokat biológiai neuronokhoz rendeli automatikusan deep learning megközelítést alkalmazva. Kapcsolódó linkek: http://www.scholarpedia.org/article/Spike_sorting https://elifesciences.org/articles/34518 https://www.biorxiv.org/content/10.1101/061481v1 https://github.com/cortex-lab/KiloSort

Kulcsszavak: deep learning, spiking neuron, biológiai idegsejt
Témavezető: Gyires-Tóth Bálint
Oktatók: Gyires-Tóth Bálint.
A következő tantárgyakhoz javasolt:
 vitma367 (Info, BSc, Önálló laboratórium, Infokommunikációs hálózatok és alkalmazások ágazat)
 vitma380 (Info, BSc, Önálló laboratórium, Médiainformatika ágazat)
 vitma387 (Önlab, IVIR szakirány)
 vitma415 (Szakdolgozat)
 vitma416 (Szakdolgozat)
 vitma417 (Szakdolgozat, IVIR szakirány)
 vitmal01 (Info, BSc, Önálló laboratórium)
 vitmm805 (Info, MSc, Önálló laboratórium 1, Hálózatok és szolgáltatások)
 vitmm811 (Info, MSc, Önálló laboratórium 1, Médiainformatika)
 vitmm855 (Info, MSc, Önálló laboratórium 2, Hálózatok és szolgáltatások)
 vitmm861 (Info, MSc, Önálló laboratórium 2, Médiainformatika)
 vitmm905 (Diplomatervezés 1. (Info, Hálózatok és szolgáltatások szakirány))
 vitmm911 (Diplomatervezés 1. (Info, Médiainformatika szakirány))
 vitmml00 (Info,MSc,Önlab.1, Internet arch. és szolg.,Adat- és médiainformatika,Mobil hálózatok és szolg. integrációja (VITMML00))
 vitmml01 (Info,MSc,Önlab.2, Internet arch. és szolg.,Adat- és médiainformatika,Mobil hálózatok és szolg. integrációja (VITMML01))
 vitma345 (Vill., BSc. Önálló laboratórium)
 vitma414 (Szakdolgozat)
 vitmm807 (Vill., MSc, Önálló laboratórium 1, Infokommunikációs rendszerek)
 vitmm857 (Vill., MSc, Önálló laboratórium 2, Infokommunikációs rendszerek)
 vitmm907 (Diplomatervezés 1. (Vill. Infokommunikációs rendszerek szakirány))
 vitmml02 (Vill,MSc,Önlab.1, Okos város,Vez.nélküli rendsz. és alk.ok,Multimédia rendsz. és szolg.,Optikai távközlés (VITMML02))
 vitmml03 (Vill,MSc,Önlab.2, Okos város,Vez.nélküli rendsz. és alk.ok,Multimédia rendsz. és szolg.,Optikai távközlés (VITMML03))
 vieum821 (Önálló munka 1)
 vieum871 (Önálló munka 2)
 vieum921 (Diplomatervezés 1 (Egészségügyi mérnök))
QR:    (mi is az?)
 
 katt. a nagyításhoz